- 辦公廳（對臺灣農(nóng)業(yè)事務辦公室）
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- 發(fā)展規(guī)劃司
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- 種植業(yè)管理司（農(nóng)藥管理司）
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- 鄉(xiāng)村建設促進司
- 農(nóng)村社會事業(yè)促進司
- 農(nóng)村合作經(jīng)濟指導司
- 幫扶司
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- 市場與信息化司
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- 農(nóng)墾局
- 種業(yè)管理司
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- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部機關服務中心( 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部機關服務局 )
- 中國農(nóng)業(yè)科學院
- 中國水產(chǎn)科學研究院
- 中國熱帶農(nóng)業(yè)科學院
- 全國農(nóng)業(yè)展覽館（中國農(nóng)業(yè)博物館）
- 中國農(nóng)業(yè)電影電視中心
- 農(nóng)民日報社
- 中國農(nóng)業(yè)出版社有限公司（農(nóng)村讀物出版社）
- 中國農(nóng)村雜志社
- 全國鄉(xiāng)村振興宣傳教育中心
- 中央農(nóng)業(yè)干部教育培訓中心（農(nóng)業(yè)農(nóng)村部管理干部學院、中國共產(chǎn)黨農(nóng)業(yè)農(nóng)村部黨校）
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部人力資源開發(fā)中心、中國農(nóng)學會
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部農(nóng)村經(jīng)濟研究中心
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部信息中心
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部農(nóng)產(chǎn)品質量安全中心
- 中國綠色食品發(fā)展中心
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- 中國鄉(xiāng)村振興發(fā)展中心
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部大數(shù)據(jù)發(fā)展中心
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部工程建設服務中心
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部財會服務中心、中華農(nóng)業(yè)科教基金會
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部對外經(jīng)濟合作中心（中國-歐洲聯(lián)盟農(nóng)業(yè)技術中心）
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部農(nóng)業(yè)貿(mào)易促進中心(中國國際貿(mào)易促進委員會農(nóng)業(yè)行業(yè)分會、中國國際商會農(nóng)業(yè)行業(yè)商會)
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- 中央農(nóng)業(yè)廣播電視學校(農(nóng)業(yè)農(nóng)村部農(nóng)民科技教育培訓中心)、中國農(nóng)民體育協(xié)會
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- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部鄉(xiāng)村振興監(jiān)測中心
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